医健通（资助）系统旨在支援长者医疗券计划及疫苗资助计划的管理及监管。医疗券透过网上系统发放及使用，以取代实体券，长者并可于网上或致电经系统查询医疗券的结存。而在疫苗资助计划中，医护提供者为病人注射疫苗前，可透过医健通（资助）系统查阅病人的疫苗接种纪录，以避免重复注射疫苗及加强保障病人安全。